DNA 的結構 · DNALab
DNA 雙螺旋結構:像沃森和克里克一樣,調節螺距、半徑和鏈數,讓計算的 X 射線衍射圖樣與照片 51 號吻合;親手組裝脫氧核苷酸、按互補配對補全另一條鏈,再把“梯子”扭成右手雙螺旋;按 PDB 1BNA 晶體結構生成任意序列的原子模型,點鹼基對看氫鍵,鹼基計算器實時驗證查哥夫規則。
章節內容
照片 51 號
1952 年,富蘭克林用 X 射線照射拉成細絲的 DNA 纖維,拍到了著名的照片 51 號:一個“X”形的十字,上下各有一個很強的斑點。
右邊的底片左半邊是按你設定的螺旋計算出的衍射圖樣,右半邊是實測圖樣。調節螺距、每圈鹼基對數、半徑和鏈數,讓兩半對上——你就像沃森和克里克一樣,從照片裡讀出了 DNA 的形狀。
X 形說明 DNA 是螺旋;上下的強斑點對應相鄰鹼基對之間 0.34 nm 的距離;X 的張角給出螺距和直徑。
動手搭 DNA 模型
DNA 的基本單位是脫氧核苷酸:一分子磷酸、一分子脫氧核糖、一分子含氮鹼基。左邊的鏈 I 已經搭好,先組裝一個脫氧核苷酸,再把另一條鏈補完整。
兩條鏈之間的鹼基按互補配對原則通過氫鍵相連:A 與 T 配對,G 與 C 配對。故意配錯試試——嘌呤與嘌呤太寬,嘧啶與嘧啶太窄。
最後確定鏈 II 的方向,再把“梯子”扭成右手雙螺旋。
DNA 雙螺旋的結構
DNA 由兩條反向平行的脫氧核苷酸鏈盤旋成雙螺旋。脫氧核糖和磷酸交替連接,排列在外側,構成基本骨架;鹼基排列在內側,兩條鏈上的鹼基通過氫鍵連接成鹼基對。
模型按 X 射線晶體結構(PDB 1BNA)生成。點一個鹼基對看氫鍵:A–T 之間 2 個,G–C 之間 3 個。
在右側改寫序列,讀數會實時驗證查哥夫規則:A = T、G = C,嘌呤數 = 嘧啶數。
隨堂檢測
回顧三個課題,完成下面的選擇題。
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